Bánh Trung thu được làm từ nhiều nguyên liệu khác nhau nên rất dễ hư mốc nếu không được bảo quản đúng cách.
Đối với những loại bánh trung thu tươi, bánh cổ truyền thường là không có chất bảo quản nên khi mua về hoặc được tặng thì ăn ngay trong thời hạn sử dụng có ghi trên bao bì là ngon nhất.